Química Ambiental y Computacional

Información General

El Grupo de Química Ambiental y Computacional (GQAC) de la Facultad de Ciencias Farmacéuticas de la Universidad de Cartagena realiza investigaciones científicas en cuatro líneas principales: Toxicología Ambiental, Biología Celular y Molecular, Parasitología Ambiental y Toxicología In Sílico.

Dentro de estas líneas, el grupo desarrolla proyectos de investigación financiados por Colciencias y otras entidades externas a la Universidad de Cartagena.

A través de los proyectos de investigación, el grupo ha logrado formar una infraestructura para el estudio de los efectos toxicológicos de los contaminantes ambientales sobre los humanos y la biota en general.

Algunos de los equipos robustos con que cuenta incluyen: Espectrofotómetro de absorción atómica con horno de grafito, Equipo automatizado de hematología, Cromatógrafo de gases – Detector de masas, Cromatógrafo líquido HPLC, Analizador directo de mercurio, Digestor de muestras biológicas, Real time PCR, Nanodrop, Fotodocumentador, Agitador de cultivos, Incubadora de CO2, Liofilizador, Rotaevaporador, Microscopio de fluorescencia, Estereoscopio, Incubadora refrigerada, Ultracongelador, Baño de maría, Multiskan, Microscopio óptico invertido, Lector de microplatos, Centrífugas refrigeradas y Cabinas de bioseguridad, Cluster de computo, Estaciones de trabajo para cálculos computacionales, entre otros.

Axiológicos

Misión

Realizar investigaciones científicas en el área de las Ciencias Ambientales y computacionales, que permitan generar conocimientos para aplicarlo en la solución de diversos problemas locales y globales.

Visión

Al 2020 ser el Centro de Investigaciones en Ciencias y Toxicología Ambiental más importante y reconocido de Latinoamérica, promoviendo la salud ambiental como plataforma fundamental para el desarrollo de la región.

Líneas

• Biología molecular.
• Ecotoxicología.
• Química ambiental.
• Química computacional.

Servicios

1. Estudios de impacto ambiental de contaminantes dispersos en el agua, suelo y/o aire, sobre organismos y humanos.
2. Análisis de expresión génica y de proteínas, evaluación de marcadores moleculares de toxicidad para diversos órganos, histopatología y desarrollo de ensayos en modelos animales in vivo.
3. Caracterización ambiental empleando sistemas de información geográfica y modelación de ecosistemas.
4. Identificación y cuantificación de contaminantes ambientales en diferentes ecosistemas. Metales pesados (Mercurio, Cadmio, Plomo, Niquel entre otros), hidrocarburos aromáticos polinucleares, dioxinas, furanos, compuestos organoclorados, organofosforados, nuevos contaminantes y parásitos.
5. Evaluación de la resistencia bacteriana a antibióticos y metales pesados.
6. Actividad antioxidante, anti quórum-sensing, genotoxicidad y repelencia a insectos por derivados de los metabolitos de bacterias.
7. Bioensayos de toxicidad con organismos marinos y de agua dulce, incluyendo fitoplancton, zooplancton y peces.
8. Programas de educación ambiental y desarrollo sostenible para empresas.
9. Cursos y Diplomados en Toxicología Ambiental y Salud Ocupacional.
10. Diseño molecular in silico, búsqueda virtual de compuestos promisorios y análisis bioinformáticos.

Reconocimientos

1. Premio Mérito Científico. Categoría Investigador. Asociación Colombiana para el Avance de la Ciencia -ACAC. Bogotá – 2014. Jesús Olivero Verbel.
2. Premio Innovación en Bolívar. Categoría Investigador. Cámara de Comercio de Cartagena. Cartagena – 2014. Jesús Olivero Verbel.
3. Mejor Presentación Oral. Primer Puesto: Modalidad Farmacología. IX Congreso Colombiano de Ciencias Farmacéuticas y XIII Simposio Colombiano de Ciencias Cosmética. Calí – 2014. Jesús Olivero Verbel.
4. Mejor Presentación Oral. Primer Puesto: Modalidad productos naturales. IX Congreso Colombiano de Ciencias Farmacéuticas y XIII Simposio Colombiano de Ciencias Cosmética. Calí – 2014. Jesús Olivero Verbel.
5. Mejor Presentación. Segundo Puesto: VII Seminario Internacional en Gestión Ambiental y II Seminario de Ciencias Ambientales. Santa Marta – 2014. Lucellys Sierra Marquez, Jesús Olivero Verbel.Mejor trabajo en Productos Naturales. FarmaCosmética. Cali, Colombia - 2014. Jesús Olivero Verbel.
6. Mejor trabajo en el área de Farmacología. Colegio Nacional de Químicos Farmacéuticos de Colombia – Septiembre de 2014- María Paulina Cabarcas.
7. Mejor trabajo en Productos Naturales. FarmaCosmética. Cali, Colombia - 2014. Jesús Olivero Verbel.
8. Beca Estudios Doctorales Nacionales. COLCIENCIAS. 2014. Universidad de Cartagena. Lucellys Sierra Marquez.
9. Beca-Pasantía: Programa Jóvenes Investigadores e Innovadores – 2014. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, Colciencias. Alejandra Manjares Suarez.
10. Premio Ex - Alumno Distinguido. Department of Pharmacology & Toxicology. Michigan State University – 2013. Jesús Olivero Verbel.
11. Premio a la Innovación de Productos Fitofarmacéuticos. Colegio Nacional de Químicos Farmacéuticos de Colombia. Bogotá, Colombia. Octubre, 2013. Jesús Olivero Verbel.
12. Premio SOT Travel Award. Sociedad de Toxicología. San Antonio. TX. Marzo, 2013. Karina Caballero Gallardo.
13. SOT Graduate Student Travel Award. Society of Toxicology. San Francisco, USA - 2013. Nerlis Pájaro Castro.
14. Premio SOT/AstraZeneca/IUTOX. San Antonio. TX. Marzo, 2013. - Karina Caballero Gallardo.
15. Beca-Pasantía. Programa Jóvenes Investigadores e Innovadores -2013. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, Colciencias. Nadia Coronado Posada.
16. Premio SOT/ Global Senior Escholar Exchange Program. Sociedad de Toxicología. San Francisco-California – 2012. Jesús Olivero Verbel.
17. Premio Alejandro Angel Escobar. Categoría Medio Ambiente - Octubre de 2012- María Paulina Cabarcas, Angélica Guerrero Castilla, José Luis Marrugo Negrete, Jesús Olivero Verbel. 
18. Nominación: Innovación en Producto. Cámara de Comercio de Cartagena. Octubre, 2012. Cartagena, Colombia. Karina Caballero Gallardo, Jesús Olivero Verbel.
19. Beca-Pasantía. Programa de Jóvenes Investigadores e Innovadores. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, Colciencias - Cámara de Comercio de Cartagena - Universidad de Cartagena. 2012. Angela Bertel Sevilla.
20. Beca Estudiante Distinguido. Maestría en Ciencias Farmacéuticas. Universidad de Cartagena - 2011. Nerlis Pájaro Castro.
21. Beca-Pasantía: Programa de Jóvenes Investigadores e Innovadores - 2011. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, Colciencias – Universidad de Cartagena. Angela Bertel Sevilla.
22. Distinción Docente Investigador "Ivo Seni Canata”. Universidad de Cartagena. Cartagena. – 2010. Jesús Olivero Verbel.
23. Premio SOT/ AstraZeneca IUTOX. Sociedad de Toxicología. Salt Lake – 2010. Jesús Olivero Verbel.
24. Mejor Presentación Oral. Tercer Puesto. Premio Francisco José de Caldas. VII Congreso de Ciencias Farmacéuticas y XI Simposio Colombiano de Ciencia y Tecnología Cosmética. Cartagena – 2010. Jesús Olivero Verbel.
25. Beca-Pasantía: Programa Jóvenes Investigadores e Innovadores – 2010. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, Colciencias. Alejandra Manjares Suarez.
26. Becario de PostDoctorado. Fundación Alexander von Humboldt.Helmholtz-Center for Infection Disease. Alemania –Junio de 2008 – Agosto de 2009. Jesús Olivero Verbel.
27. Becario de Colciencias. PostDoctorado. Michigan State University. East Lansing, MI. Agosto de 2006 – Junio de 2008. Jesús Olivero Verbel.
28. Beca-pasantía: Programa Jóvenes Investigadores e Innovadores – 2005. Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, Colciencias. Karina Caballero Gallardo.
29. Mejor Presentación Oral. Segundo Puesto. Premio Francisco José de Caldas. V Congreso Nacional de Ciencias Farmacéuticas. Medellín – 2006. Jesús Olivero Verbel.
30. Mejor Poster. Segundo Puesto. Congreso Nacional de Fitoquímica. Sincelejo – Octubre de 2005. Jesús Olivero Verbel.
31. Diez Jóvenes Sobresalientes Ejecutivos de Colombia. Cámara Junior de Colombia - Capítulo Bogotá – Octubre de 2003. Jesús Olivero Verbel.
32. Joven Sobresaliente de Cartagena. Categoría Contribuciones Científicas o Tecnológicas. Cámara Junior de Colombia - Capítulo Cartagena. Cartagena – Octubre de 2001. Jesús Olivero Verbel.
33. Premio Taylor & Francis. Outstanding Graduate Student. Sociedad de Toxicología de USA. Food Safety Specialty Section. Philadelphia. USA. – Marzo de 2000. Jesús Olivero Verbel.
34. Premio Nacional de Ecología. Mención de Honor. Banco de Occidente. Barranquilla, Colombia. – Junio de 1999. Jesús Olivero Verbel.
35. Premio Carl C. Smith Graduate Student. Mechanisms Specialty Section of SOT. Mención de Honor. Sociedad de Toxicología. USA. New Orleans – Marzo de 1999. Jesús Olivero Verbel.
36. Premio Ph.D. Scholarship. Fulbright-Colciencias-Laspau. Bogotá, Colombia – 1996. Jesús Olivero Verbel.
37. Premio Francisco José de Caldas, Merck Colombia S. A. 1995. María Teresa de Vélez.

Publicaciones

1. Marrugo-Negrete J., Durango-Hernández J., Pinedo-Hernández J., Olivero-Verbel J., Díez S. 2015. Phytoremediation of mercury-contaminated soils by Jatropha curcas. Chemosphere. 127:58-63.

2. Olivero-Verbel, J., Caballero-Gallardo, K., Turizo-Tapia, A. 2015. Mercury in the gold mining district of San Martin de Loba, South of Bolivar (Colombia). Environ. Sci. Pollut. Res. Int. 22(8):5895-907.

3. Guerrero-Castilla, A., Olivero-Verbel, J. 2014. Altered gene expression in HepG2 cells exposed to a methanolic coal dust extract. Environ. Toxicol. Pharmacol. 38(3):742-50.

4. Siverio-Mota, D., Andujar, I., Marrero-Ponce, Y., Olivero-Verbel, J., Giner, R.M., Vicet-Muro, L., Cordero-Maldonado, ML., de Witte, PA, Crawford, AD, Veitía, MS, Pérez-Jiménez, F, Aran VJ. 2014. Pharmacological Evaluation of the Anti-Inflammatory Activity and Chemoinformatic Analysis of New Potent 2-Substituted 1-Methyl-5-Nitroindazolinones. Curr. Top. Med. Chem. In press.

5. Garcia-Jacas, CR., Marrero-Ponce, Y., Barigye, SJ., Valdes-Martini, JR., Rivera-Borroto, OM., Olivero-Verbel, J. 2014. N-Linear Algebraic Maps for Chemical Structure Codification: A Suitable Generalization for Atom-pair Approaches?. Curr. Drug. Metab. 15:441-469.

6. Montes Grajales, D., Olivero-Verbel. 2015. EDCs DataBank: 3D-Structure database of endocrine disrupting chemicals. Toxicology. 327: 87-94.

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9. Narváez-Pita, X., Ortega-Zuniga, C., Acevedo-Morantes, C.Y., Pastrana, B., Olivero-Verbel, J., Maldonado-Rojas, W., Ramírez-Vick, J.E., Meléndez, E. 2014. Water soluble molybdenocene complexes: Synthesis, cytotoxic activity and binding studies to ubiquitin by fluorescence spectroscopy, circular dichroism and molecular modeling. J. Inorg. Biochem. 132:77-91.

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15. Guerrero-Castilla, A., Olivero-Verbel, J., Marrugo-Negrete, J. 2014. Heavy metals in wild house mice from coal-mining areas of Colombia and expression of genes related to oxidative stress, DNA damage and exposure to metals. Mutat Res Genet Toxicol Environ Mutagen 762:24-9.

16. Caballero-Gallardo, K., Olivero-Verbel, J., Pino-Benítez, N., Stashenko, E. 2014. Chemical composition and bioactivity of Piper auritum and P. multiplinervium essential oils against the flour beetle, Tribolium castaneum (herbst). Boletin Latinoamericano y del Caribe de Plantas Medicinales y Aromáticas. 13(1): 10-19.

17. Durán-Lengua, M., Gaitán-Ibarra, R, Olivero-Verbel, J. 2013. Búsqueda en bases de datos de actividad biológica de moleculas quinoides. Revista Cubana de Información en Ciencias de la Salud. 24(4):416-430.

18. Manjarres-Suarez, A., Olivero-Verbel, J. 2013. Control Químico de Aedes aegypti: Una Perspectiva Histórica. Revista Costarricense de Salud Pública. 22(1):68 – 75.

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22. Montes Grajales, D., Olivero-Verbel, J. 2013. Computer-aided identification of novel protein targets of bisphenol A. Toxicol Lett. 22(9):312–320.

23. Coronado-Posada, N., Cabarcas-Montalvo, M., Olivero-Verbel, J. 2013. Phytotoxicity assessment of a methanolic coal dust extract in Lemna minor. Ecotoxicology and Environmental Safety. 95:27-32.

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30. Cabarcas-Montalvo, M., Olivero-Verbel, J., Corrales-Aldana, H. 2012. Genotoxic effects in blood cells of Mus musculus and Iguana iguana living near coal mining areas in Colombia. Sci. Total Environ. 1(416):208-14.

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35. Maldonado-Rojas, Wilson., Noguera-Oviedo, K., Olivero-Verbel, J. 2011. Acoplamiento inverso y mapeo de farmacóforo como herramientas para encontrar nuevos blancos farmacológicos de compuestos naturales. Revista de la Academia Colombiana de Ciencias, Físicas y Naturales. ACCEFIN. 140:411-420.

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37. Pájaro-Castro, N., Olivero-Verbel, J. 2011. Química verde: Un nuevo reto. Ciencia e Ingeniería Neogranadina. 21-22:169 – 182.

38. González-Carrasco, V., Velasquez-Lopez, P.C., Olivero-Verbel, J., Pájaro-Castro, N. 2011. Air mercury contamination in the Gold Mining Town of Portovelo, Ecuador. Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology. 87(3):250-3.

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40. Olivero-Verbel, J., Guerrero-Castilla, A., Reyes-Ramos, N. 2011. Biochemical effects induced by the hexachlorocyclohexanes. Rev. Environ. Contam. Toxicol. 212:1-28.

41. Olivero-Verbel, J. 2011. Colombia: Environmental Health Issues/00395. Encyclopedia of Environmental Health (NVRN). Elsevier. 2011.

42. Olivero-Verbel, J., Roth, R., Ganey, P. 2011. Dioxin alters inflammatory responses to lipopolysaccharide. Toxicological and Environmental Chemistry. 93(6):1180-94.

43. Jaramillo-Colorado, B, Olivero-Verbel, J, Stashenko, E.E, Wagner-Döbler, I, Kunze, B. 2011. Anti-quorum sensing activity of essential oils from Colombian plants. Natural Products Research. 26,1075-1086

44. Caballero-Gallardo, K., Olivero-Verbel, J., Stashenko, E. 2011. Repellent activity of essential oils and some of their individual constituents against Tribolium castaneum Herbst. Journal Agriculture and Food Chemistry. 59,1690-1696.

45. Maldonado-Rojas, W, Olivero-Verbel, J. 2011. Potential interaction of natural dietary bioactive compounds with COX-2. Journal of molecular graphics & modelling. 30:157-66.

46. Maldonado-Rojas, W, Olivero-Verbel, J., Ortega-Zúñiga, C. 2011. Searching of protein targets for Alpha Lipoic Acid. J. Braz. Chem. Soc. 1-10.

47. Olivero-Verbel, J., Pájaro-Castro, N., Stashenko, E. 2011. Antiquorum sensing activity of essential oils isolated from different species of the genus piper. VITAE. 18(1):77-82.

48. Olivero-Verbel, J., Castillo, A., Stashenko, E. 2010. Toxicity of essential oil of the cytral chemotype of Lippia alba (Mill.) N.E. Brown. Acta Toxicol. Argent. 18(1): 21-27.

49. Marrugo-Negrete, J, Benítez, L.N, Olivero-Verbel, J., Lans, E., Vazquez-Gutierrez, F. 2010. Spatial and seasonal mercury distribution in the Ayapel Marsh, Mojana region, Colombia. International Journal Environmental Health Research. 20(6):451-9.

50. Olivero-Verbel, J., Cabarcas-Montalvo, M., Ortega-Zúñiga, C. 2010. Theoretical targets for TCDD: a bioinformatics approach. Chemosphere. 80(10):1160-6.

51. Olivero-Verbel, J. González, T., Güette, Jorge., Jaramillo, B., Stashenko, E. 2010. Chemical composition and antioxidant activity of essential oils isolated from Colombian plants. Revista Brasileira de Farmacognosia. 20(4):568-574.

52. Noguera-Oviedo, K., Olivero-Verbel, J. 2010. Second Life : una plataforma ideal para la química virtual. Revista Científica Guillermo de Ockham. 8(1): 65-72.

53. Noguera, K., Olivero-Verbel, J. 2010. Los rellenos sanitarios en Latinoamérica: Caso Colombiano. Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas y Naturales. XXXIV(132): 346-356.

54. Olivero-Verbel, J., Nerio, L., Stashenko, E. 2010. Bioactivity against Tribolium castaneum Herbst (Coleoptera: Tenebrionidae) of Cymbopogon citratus and Eucalyptus citriodora essential oils grown in Colombia. Pest Managent Science. 66(6):664-8.

55. Nerio, L., Olivero-Verbel, J., Stashenko, E. 2010. Repellent activity of essential oils: a review. Bioresources Technologies. 101(1):372-378.

56. Vera, A., Olivero-Verbel, J., Jaramillo, B., Stashenko, E. 2010. Efecto protector del aceite asencial de Lippia alba (Mill.) N.E. Brown sobre la toxicidad del mercurocromo en raíces de Allium cepa L. Revista Cubana de Plantas Medicinales. 15(1):1-7.

Proyectos

1. Colciencias-Universidad de Cartagena. 2012-2015. Perfil genotóxico, transcripcional, y epigenético asociado con la exposición de particulas de carbón en roedores. Código: 1107 -569-33952. Contrato No. 323 de 2012. En ejecución.
2. Colciencias-Universidad de Cartagena. 2012-2015. Coeficiente intelectual, marcadores hematológicos, celulares y moleculares, asociados con daño genotóxico en niños expuestos a plomo. Contrato No. 323 de 2012. En ejecución.
3. Ministerio de Educación Nacional-Universidad de Cartagena. 2012-2013. Creación de programas de Doctorado a partir de programas de Maestría. En ejecución.
4. Colciencias-Universidad de Cartagena. 2012-2014. Metabolitos aislados de myxobacterias provenientes de sedimentos marinos colombianos como antimicrobianos e inhibidores de quórum Sensing. Código: 110752129360. En ejecución.
5. Genotipificación de cepas de Plasmodium y susceptibilidad in vitro frente a fármacos a partir de aislados clínicos en pacientes infectados del sur Bolívar (Colombia).
6. Colciencias-Universidad de Cartagena. 2010-2012. Búsqueda virtual y evaluación in vitro de moléculas inhibidoras de la proteasa NS2B/NS3 del virus del dengue. Código: 110751929058. En ejecución.
7. CENIVAM - Universidad de Cartagena. 2010-2012. Centro Nacional de Investigaciones para la Agroindustrialización de Especies Vegetales Aromáticas y Medicinales Tropicales. En ejecución.
8. Alcaldía de Barrancabermeja-Universidad de Cartagena. 2012-2014. Estudio y evaluación de marcadores de toxicidad en organismo presentes en la Ciénaga Miramar. Contrato No. 10/18 de 2012. Terminado.
9. Colciencias - Universidad de Cartagena. 2010-2012. Evaluación de la toxicidad de los sedimentos contaminados con carbón en el departamento del Magdalena. Código: 110749326186. Terminado.
10. Colciencias - Universidad de Cartagena. 2009-2011. Diseño, síntesis y evaluación de la activación del receptor de insulina por derivados del ácido alfa-lipoico. Código: 110745921616. Terminado.
11. Universidad de Cartagena - Vicerrectoría de Investigaciones. 2010-2011. Creación de un servidor web para la búsqueda en tiempo real de moléculas reportadas en Pubchem con alta afinidad in silico por proteínas blanco de interés terapéutico. Terminado.
12. Universidad de Cartagena - Vicerrectoría de Investigaciones. 2010-2011. Relación entre el plomo sanguíneo, el coeficiente intelectual y alteraciones en la línea celular Mieloide/Linfoide en niños que habitan en fundidoras de metales en Cartagena. Terminado.
13. Universidad de Cartagena - Vicerrectoría de Investigaciones. 2009-2011. Efectos de tremátodos asislados de Mugil incilis (Lisa) de la costa Atlántica Colombiana sobre la función e integridad hepática en un modelo de infección parasitaria en ratones. Terminado.
14. Universidad de Cartagena - Vicerrectoría de Investigaciones. 2009-2010. Diseño de una red nanomolecular para el atrapamiento del virus de inmunodeficiencia humana VIH. Terminado.
15. Universidad de Cartagena - Vicerrectoría de Investigaciones. 2009-2010. Modelamiento 3D de tropomiosinas y evaluación de su alergenecidad y reactividad cruzada. Terminado.
16. Gobernación del Cesar - Universidad de Cartagena. 2009-2012. Estudios y evaluación de marcadores de toxicidad en tres especies animales provenientes de la zona de influencia de la minería del carbón en el departamento del Cesar. Terminado.
17. Cardique-Universidad de Cartagena. 2005. Caracterización del ciclo de vida de parásitos nemátodos en los ecosistemas de la bahía de Cartagena y el canal del Dique y su relación con la calidad del agua. Convenio 057/05. Terminado.
18. Colciencias-Universidad de Cartagena. 2004. Desarrollo de un sistema de información para la detección temprana de intoxicación mercurial en el norte de Colombia. Project No. 1107-04-16346. Terminado.
19. European Union. 2004. Biomercury Project. Project No. NMP 2-CT-2004-505561. Terminado.
20. Colciencias. 2003. PAHs in sediments from the Cartagena Bay and their impact on the biochemical and pathological condition of Lisa (Mugil incilis). Terminado.
21. Universidad de Cartagena. First University Science Week. Cartagena, Colombia. 2001. Blood lead monitoring in children from Cartagena. Terminado.
22. UNESCO. Montevideo, Uruguay. 1999. Mercury levels in the gold mining zone in Colombia. Terminado.
23. Gobernación de Bolívar – CORPOMAGDALENA. Cartagena, Colombia, 1998. Mercury levels in fish from the Magdalena River, Colombia. Terminado.
24. Financiera Eléctrica Nacional. Bogotá, Colombia. 1997. Mercury contamination in the South of Bolívar, Colombia. Terminado.
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